A92131.「CodePlus 2017 11 月赛」找爸爸
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题目描述
小 A 最近一直在找自己的爸爸,用什么办法呢,就是 DNA 比对。
小 A 有一套自己的 DNA 序列比较方法,其最终目标是最大化两个 DNA 序列的相似程度,具体步骤如下:
- 给出两个 DNA 序列,第一个长度为 n,第二个长度为 m。
- 在两个序列的任意位置插入任意多的空格,使得两个字符串长度相同。
- 逐位进行匹配,如果两个序列相同位置上的字符都不是空格,假设第一个是 x,第二个是 y,那么他们的相似程度由 d(x,y) 定义。对于两个序列中任意一段极长连续空格,设其长度为 k,我们定义这段空格的相似程度为 g(k)=−A−B×(k−1),其中 A,B 均为正整数。
那么最终两个序列的相似程度就是所有的 d(x,y) 加上所有的极长空格段的相似程度之和。
现在小 A 通过某种奥妙重重的方式得到了小 B 的 DNA 序列中的一段,他想请你帮他算一下小 A 的 DNA 序列和小 B 的 DNA 序列的最大相似程度。
输入格式
输入第 1 行一个字符串,表示小 A 的 DNA 序列。
输入第 2 行一个字符串,表示小 B 的 DNA 序列。
接下来 4 行,每行 4 个整数,用空格隔开,表示 d 数组,具体顺序如下所示。
d(A,A) d(A,T) d(A,G) d(A,C)
d(T,A) d(T,T) d(T,G) d(T,C)
d(G,A) d(G,T) d(G,G) d(G,C)
d(C,A) d(C,T) d(C,G) d(C,C)
最后一行两个用空格隔开的正整数 A,B,意义如题中所述。
输出格式
输出共一行,表示两个序列的最大相似程度。
输入输出样例
输入#1
ATGG ATCC 5 -4 -4 -4 -4 5 -4 -4 -4 -4 5 -4 -4 -4 -4 5 2 1
输出#1
4
说明/提示
对于所有测试点,有 0<B<A≤1000,−1000≤d(x,y)≤1000,d(x,y)=d(y,x),序列只包含 {A,T,G,C} 四种字符。
| 测试点编号 | n+m 的范围 | 特殊约定 |
|---|---|---|
| 1 | n=m=1 | 无特殊要求 |
| 2 | n+m≤15 | 无特殊要求 |
| 3 | n+m≤300 | 无特殊要求 |
| 4 | n+m≤300 | 无特殊要求 |
| 5 | n+m≤3000 | 序列中只包含一种字符 |
| 6 | n+m≤3000 | 无特殊要求 |
| 7 | n+m≤3000 | 无特殊要求 |
| 8 | n+m≤3000 | 无特殊要求 |
| 9 | n+m≤3000 | 无特殊要求 |
| 10 | n+m≤3000 | 无特殊要求 |
来自 CodePlus 2017 11 月赛,清华大学计算机科学与技术系学生算法与竞赛协会 荣誉出品。
Credit:idea/邢健开 命题/邢健开 验题/陈宇
Git Repo:https://git.thusaac.org/publish/CodePlus201711
感谢腾讯公司对此次比赛的支持。